프톨레마이오스 Ptolemaic 왕조 시대에 필레섬에 건설 되었던 이시스 신전은 하이댐의 건설로 섬이 수몰 될 상황에 처했으나 1974년부터 1980년까지 진행된 유네스코 복원 사업에 의해 원래의 필레섬에서 약 550m정도 떨어진 현재의 아기르키아 Agirkia 섬으로 옮겨 지게 되었다. 신화에 의하면 이시스 신전은 그녀의 남편인 오시리스의 찢겨 버려진 시신들을 찾아내었던 중요한 곳으로 알려져있다. 이시스 신전은 몇 개의 유적들을 제외하고는 대부분 오시리스 신화 및 이시스 여신과 관련되어 있다. 신전의 건축은 약 800년 동안 진행되었는데 고대 이집트와 그레코로만 건축양식이 절묘하게 조합된 걸작이라고 평가되고 있다.

제 1탑문
이시스 신전으로 들어가는 입구 양 쪽으로 세워 진 커다란 탑문이다. Ptolemy 2세(BCE 80~)시대에 세워진 것으로 탑문에 새겨진 조각이 너무나 선명하여 멀리서도 한 눈에 알아볼 수 있다. 대부분이 이시스와 호루스에 대한 내용이다. 이시스는 호리호리한 몸에 머리에 쇠뿔 모양의 관 위에 둥근 원형판을 쓰고 있는 모습을 하고 있고 호루스는 머리에 관을 쓰고 얼굴은 새의 형상을 하고 있다.

중앙 입구 & 사자상
이시스 신전으로 들어가는 중앙 입구로 그 앞에는 두 마리의 사자상이 자리하고 있다. 입구를 통해 신전 안쪽으로 연결된 안뜰과 탄생소로 이어진다.

탄생의 집
이시스 신전 아뜰의 서쪽에 자리하고 있는 건물로 Ptolemy 6세의 탄생 장소로 알려져 있다. 탄생의 집의 오른쪽으로는 열주들로 굴러진 안뜰과 성역으로 통하는 문이 이어진다. 벽면에는 이시스가 호루스를 낳는 장면과 습지에서 호루스를 돌보는 모습들이 새겨져 있다. 이시스는 남편을 죽인 세트로부터 아들인 호루스를 보호하기 위해 호루스를 습지에 숨겨 키워야만 했다.

하드리안의 문
열주들이 늘어선 신전 안쪽으로 첫 번째 뜰의 서쪽으로 난 입구 근처에 하드리안의 문이 자리하고 있다. 하드리안의 문의 양쪽 벽면에는 이시스와 그녀의 여동생인 네프티스 Nepthys, 호루스 그리고 오시리스의 모습들이 새겨져 있는 부조로 장식 되어 있다.

이시스 신전 뒤로 나세르 호 앞으로 Augustus 신전과 Diocletian 문이 자리하고 있다. 나세르 호를 걸어 나오다 보면 이시스 신전의 동쪽으로 오시리스 신화와 관련 있는 하토르 Hathor 신전이 자리하고 있다. 그 앞쪽으로 트라얀 Trajan 의 침소가 있다.